74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1275 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  31.82 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  30.98 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  29.78 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  28.25 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  30.28 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  27.87 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  28.74 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  27.96 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  27.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  32.26 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  30.28 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  26.59 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  32.84 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  30.47 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  27.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  28.57 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  45.71 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.26 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.66 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>