102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  52.69 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  45.85 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  40.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  32.24 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  40.43 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  25.43 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.61 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  28.11 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  54.76 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  56.25 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  59.46 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 253 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 195 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  63.33 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>