133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1382 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2965  regulatory protein, TetR  39.58 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.400188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2888  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6247  regulatory protein, TetR  33.13 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2247  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 390 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 403 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 309 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 414 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 363 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 423 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 470 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>