More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0767 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  38.93 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  53.03 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  32.75 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  53.97 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.65 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  36.94 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  48.28 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2444  regulatory protein TetR  40.67 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  44.29 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  51.67 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.44 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  40.23 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>