176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2444 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2444  regulatory protein TetR  100 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  53.41 
 
 		 182 aa  161  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  39.49 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.43 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  42.15 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  42.25 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  37.18 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  30.38 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>