More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0312 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  356  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1396  transcriptional regulator, TetR family  69.54 
 
 		 175 aa  221  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  38.02 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  40 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  40.58 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  45.71 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  54 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>