More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5421 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  40.12 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  37.75 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 299 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.21 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  45.76 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  43.94 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  52 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 261 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.22 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 445 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>