More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4158 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 445 aa  893    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 482 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 482 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  47.52 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.52 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32.68 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 215 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 208 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 222 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 190 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 196 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 242 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 195 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 215 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 307 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 198 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 184 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 179 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.1 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 178 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 178 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 211 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 211 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 207 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 196 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 182 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  46.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 196 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 198 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 221 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  47.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 203 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 186 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>