More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5635 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  29.84 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  43.02 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  23.37 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  24.76 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  40.68 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  46.94 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.94 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  38.18 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>