More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3229 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3915  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5920  hypothetical protein  40.32 
 
 		 172 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0872061  normal  0.0262514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1471  hypothetical protein  39.02 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  38.82 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  33.72 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  36.84 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>