More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3905 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.44 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  26.62 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 446 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  32.73 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 414 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
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NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
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