57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4093 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  59.59 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  44.9 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 221 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  25.34 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 229 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 237 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  39.73 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>