More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1588 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  85.2 
 
 
196 aa  331  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  77.05 
 
 
195 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  77.05 
 
 
195 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  77.05 
 
 
195 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  53.41 
 
 
223 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
207 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
211 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
209 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
200 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
210 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
208 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  43.51 
 
 
145 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  34.34 
 
 
635 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.9 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
209 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.91 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
214 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  36.84 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
227 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
272 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
242 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
209 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
241 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
126 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30.65 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  36.49 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
264 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
308 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.96 
 
 
208 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  41.38 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
188 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
204 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  27.97 
 
 
198 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
192 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
230 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
196 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  34.62 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
212 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
600 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>