More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6580 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 197 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 206 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.21 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.74 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>