More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0754 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  80.17 
 
 		 266 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  59.91 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  58.59 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  60.78 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 232 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  54.12 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  54.27 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 242 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  53.41 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 214 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 214 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 209 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.98 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  32.84 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 211 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  27.92 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.46 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>