More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3176 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
200 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
383 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.17 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 
192 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 
192 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 
228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
224 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
192 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
185 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 
224 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
216 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
234 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  36.22 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
213 aa  95.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  46.03 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.72 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
209 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  31.67 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
230 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  30.41 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  36.99 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  34.43 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.93 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
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NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
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NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  26.86 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.61 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
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NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.85 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
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NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
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