More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3923 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  49.49 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 273 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 266 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  32.34 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.85 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  26.29 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.45 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.04 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  46.03 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.27 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.22 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>