More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6397 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  79.43 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  46.37 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  44.69 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  32.29 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  32 
 
 		 264 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  26.67 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  34.03 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
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