More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0737 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 209 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  43.78 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  42.29 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  40.11 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40.33 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.61 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.33 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  31.49 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  42.55 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.27 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  30.96 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
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