More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1252 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  58.16 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 287 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  34.18 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  35.76 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  39.62 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  35.75 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.26 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
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NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
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NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
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