More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1231 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 205 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 		 191 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 236 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 202 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5357  transcriptional regulator  67.69 
 
 		 71 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.285824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.89 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  35.83 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  33.1 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30.67 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  35.78 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
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