More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1447 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  35.51 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  26.32 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.65 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  36.61 
 
 
145 aa  72  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.43 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.49 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  51.67 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
234 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  37.61 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  35.04 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.88 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  29.36 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
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NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
420 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  34.88 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  27.27 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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