More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0705 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  74.26 
 
 		 207 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  72.41 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2962  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.35 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.15 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.07 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  23.67 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.34 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
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NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.14 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.75 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.93 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
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