More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5246 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  91.3  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.02 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.15 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.18 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 257 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.06 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.08 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  28.8 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  21.74 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.03 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  25.82 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>