More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5999 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  76.28 
 
 		 215 aa  336  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.82 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.77 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.12 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.15 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  28.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.17 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  33.91 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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