169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0679 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  30.69 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.78 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  21.35 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  47.92 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.19 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.38 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  34.07 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  42.55 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.07 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  42 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>