More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0296 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  28.84 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  44.93 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  34.44 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  43.1 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  32 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>