More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1663 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  32.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  45.31 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 255 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  35.45 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 420 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 229 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.81 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>