47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 325 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  36.54 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  35.26 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 218 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  48 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>