167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0123 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 187 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  35.63 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  25.3 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>