268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2461 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  36.81 
 
 
187 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
211 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
235 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
274 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 
321 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 
194 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  28.28 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
192 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
210 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.4 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
214 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  33.87 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  39.34 
 
 
206 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
208 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
188 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
188 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
226 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  23.53 
 
 
216 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
257 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  36.25 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
391 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
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