More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5157 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  82.96 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  64.19 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  67.3 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  33.09 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  30.52 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.52 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  32.86 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  32.86 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  39.34 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  29.35 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>