278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9268 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  31.09 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 321 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  35.23 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  31.75 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  32.26 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  28.68 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 403 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  37.5 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 235 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  39.13 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  29.91 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  33.66 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>