109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4591 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  46.49 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  46.54 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  40 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.23 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  25.32 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  28.15 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  25 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  31.31 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.23 
 
 		 207 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 188 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 202 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 203 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>