275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  56.91 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  49.47 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  44.27 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  41.15 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  34.81 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  20.71 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  30.91 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  35.44 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.81 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  32 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>