142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2776 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  86.8 
 
 		 197 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  52.82 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 279 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  47.57 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  48.4 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  36.65 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  37.88 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 255 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  57.5 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  19.54 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  29.3 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>