More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3873 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 225 aa  221  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  34.15 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.23 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.23 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.7 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>