More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3721 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 233 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 232 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  45.54 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  34.13 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  34.03 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  35.22 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  39.05 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  32.04 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  32.09 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.67 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  39.34 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>