More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1317 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  63.88 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  67.3 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  27.61 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  27.57 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  23.78 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  23.78 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  23.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  23.78 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  23.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  23.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  23.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  29.21 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  39.68 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>