188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0369 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  79.26 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  25.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.88 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 270 aa  45.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 265 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.96 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>