More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3977 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  60.56 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  40.54 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 333 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.49 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 237 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 406 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  38.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 391 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  35.16 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>