More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  549  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  50.88 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  27.63 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.96 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 194 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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