More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2111 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.4 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  28.72 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  28.19 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  30.61 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 98 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.46 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.73 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  42.25 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 497 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>