More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4624 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  90.86 
 
 		 197 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 228 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 228 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 228 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  49.12 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  29.05 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.19 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>