More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1775 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.08 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  34.46 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.44 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.55 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  50 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  31.82 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  36.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.64 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>