60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4911 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  51.72 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  53.09 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  26.98 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 308 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  32.28 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 212 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  29.37 
 
 		 202 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 262 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 285 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
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