99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3973 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 227 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.23 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 385 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  26.87 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 285 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 240 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 238 aa  42  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 210 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>