More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4096 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  37.38 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.5 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  31.52 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  39.66 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.03 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.03 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
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NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
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NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.03 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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