More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7183 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  50.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
215 aa  203  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  36.36 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  31 
 
 
202 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 
217 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 
219 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 
189 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  34.52 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  20.22 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  21.27 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.87 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  23.86 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1919  regulatory protein TetR  30.1 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543101  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
497 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
188 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 
233 aa  48.5  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.7 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.7 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.95 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.7 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
209 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
197 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 
228 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.7 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.7 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.7 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  24.38 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  23.42 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.7 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
243 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>