155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0733 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  25.54 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 421 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  27.08 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  24.46 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  26.4 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.73 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 278 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 446 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  34.85 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>